4G/5G polymorphism in the PAI‑1 gene

Inhibitor aktivátoru plazminogenu-1 (PAI-1) je důležitým biomarkerem fibrinolýzy. Tento glykoprotein působí jako hlavní inhibitor aktivátorů plazminogenu a jeho vysoká hladina v plazmě je asociována s různými typy onemocnění, například kardiovaskulárními chorobami. Promotor genu PAI-1 obsahuje 4G/5G inzerční/deleční polymorfizmus. Varianta 4G vede ke zvýšenému přepisu genu a tím dochází k zvýšení PAI-1 proteinu v plazmě (jedinci s 4G/4G genotypem mají hladinu plazmatického PAI-1 o 25 % vyšší než jedinci s 5G/5G genotypem). Přítomnost 4G varianty v promotoru genu PAI-1 zvyšuje riziko vzniku trombóz v případě, že jsou přítomny další rizikové faktory jako je Leidenská mutace faktoru V nebo antifosfolipidový syndrom. Jedinci s 4G alelou mají vyšší riziko vzniku koronárních syndromů a infarktu myokardu, ženy mají vyšší výskyt komplikací během těhotenství a porodu. Vyšetření provádíme metodou Real-time PCR. Tato metoda umožňuje monitorovat průběh reakce v libovolném okamžiku amplifikační reakce. Každý jednotlivý cyklus má shodné vlastnosti jako klasická PCR tj. denaturace dvouřetězové DNA, nasednutí primerů, extenze řetězce pomocí Taq DNA polymerasy. Při anelaci ovšem nasednou nejen příslušné primery, ale i sondy (specifické oligonukleotidové sekvence DNA) s fluorofory. Selektivita detekce je zajištěna specifickými sondami.

Plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) is an important biomarker of fibrinolysis. This glycoprotein acts as a major inhibitor of plasminogen activators and its high plasma levels are associated with various types of diseases, such as cardiovascular diseases. The PAI-1 gene promoter contains a 4G/5G insertion/deletion polymorphism. The 4G variant leads to increased gene transcription and therefore increased plasma PAI-1 protein level (individuals with 4G/4G genotype have plasma PAI-1 levels 25% higher than individuals with 5G/5G genotype). The presence of the 4G variant in the PAI-1 promoter increases the risk of thrombosis when other risk factors, such as Leiden factor V mutation or antiphospholipid syndrome, are present. Individuals with the 4G allele have a higher risk of developing coronary syndromes and myocardial infarction, women have a higher incidence of complications during pregnancy and delivery. It is tested by real-time PCR. This method enables monitoring of the progress of the amplification reaction at any point. Each individual cycle has the same properties as classical PCR, i.e. denaturation of double-stranded DNA, primer mounting, chain extension by Taq DNA polymerase. When annealing, not only the appropriate primers are used, but also probes (specific DNA oligonucleotide sequences) with fluorophores. Detection selectivity is ensured by specific probes.

Before initiating combined oral hormonal contraception and/or hormone replacement therapy (HRT) in women with a positive personal history of TEN or a positive family history of TEN in first-degree relatives (mother, father, siblings and children), in women with primary sterility or recurrent abortions in the first trimester of pregnancy or in any foetal loss after this period of gestation, in pregnant women with a positive personal or family history of TEN (see Section 1) or in severe forms of preeclampsia, foetal retardation, placental abruption and stillbirth, in persons with a history of idiopathic TEN to determine the causative cause and to decide on the duration of anticoagulant therapy. If thrombophilic mutations are positively detected, it is advisable to perform these tests in first-degree relatives. In children older than 12 years, unless there are other reasons to perform this testing sooner, or from another indication after examination in the Thrombotic Centre, or indications are part of the Recommended Practice of the Society for Medical Genetics and Genomics, J. E. Purkyne Czech Medical Society – see https://slg.cz/doporuceni/trombofilni-stavy/